네, 첫번째 설치한 폴더 이름을 바꾸고 다시 설치하면 가능합니다만, 추천하고 싶지는 않네요...

1. 처음 설치한 c:\Rcount 의 폴더명을 c:\Rcount2 로 변경합니다.
2. 윈도 탐색기에서 c:\Rcount2 안에 들어가 Rcount.exe 를 바탕화면에 바로가기를 만듭니다.
(마우스로 Rcount.exe 를 선택하고, 우클릭 팝업메뉴에서 [보내기] - [바탕화면에 바로가기만들기] 선택)
3. 바탕화면에 생성된 바로가기 이름을 [A회사용] 으로 바꿔서 사용합니다.

4. 알찬회계를 또 다시 설치합니다. (그러면 다시 c:\Rcount 에 설치됩니다)
5. 바탕화면에 자동 생성된 바로가기는 B회사용으로 사용합니다.

이런식으로 가능하기는한데 A회사 알찬회계가 사용중일때 B회사 바로가기를 실행하면 A회사가 아직 살아 있기 때문에 A회사 알찬회계가 앞으로 나옵니다. B회사용을 사용하려면 사용중이던 A회사를 닫고 실행해야 합니다.

즉, 가능하기는 한데 화면이 똑같으니 어느게 어느건지 무척 헷갈리실 겁니다.
나중에 유료버전 나오면 알찬회계 1개에 회사를 여러개 등록할 수 있으니 그때 사용하시죠?.....ㅎ